鱼缸里面的水因为大量喂食、排析物和鱼身上的分秘物的产生，会有越来越多的有机物质积累，这些有机质废物会凝聚、附着在缸壁上，而大量的都悬浮在水中或沉于底砂上。由于水温高，有机物会加快腐败，导致混浊度增加，水质变坏，溶氧量明显降低，氨及硝酸盐大量增加，水会变得十分浑浊，鱼在这样的水中生活极易得病，甚到死亡。在鱼缸中建成一个生态过滤系统，进行有效的生态过滤，将有机质分解，就可以减少这些附着物的产生，不仅将水中的固体废物过滤清除，使水体变得十分清澈，水质稳定，还可以有效减少鱼病的发生。
市场有些劣质饵料，为增加卖相会加入色素，喂用时饵料中的色素溶入水里，就使水变为色，如出现此情况就应更换饵料才能沏底解决。
水草也是净化水体的好帮手，应该尽量多养水草，使整个水族缸变成一个小小的生态乐园，水体自然就变得十分清澈。
在缸中投放清道夫和食苔虾，它们能清除附着在缸壁上的污垢和藻类，使缸壁清晰。
具备了如上条件，您的水族缸中的水自然会是十分清洁的，虽然在底砂中仍会看到固体渣滓，但并不会影响到水的清晰，是无害的，如果种了水草还是肥料，可以减少水草肥的用量。
一般采用溢流方式过滤的大型鱼缸，都会在水面处开一个溢流口，直接将油膜导入过滤系统中过滤分解。
采用上滤、瀑布等方式过滤的小缸，可以在水面添加一个入水口，直接吸取油膜，动手能力不强的的话，水族店里和淘宝网上有成品，叫除油膜器。但这种除油膜器不建议使用在过滤桶上，因为其可能导致过滤桶内吸入大量空气，干扰水泵正常工作，甚至烧泵。