电子银行承兑汇票背书是指电子银行承兑汇票背书人依法将电子票据交付被背书人的行为。电子银行承兑汇票通过电子化的手段完成票据流转，电子银行承兑汇票背书人通过网上银行、银行柜台或其他电子终端登录，录入背书申请信息（包括票据信息、背书人信息、被背书人信息），使用背书人的数字证书加盖电子签名；
电子银行承兑汇票背书背书流转，在被背书人发起回复之前，背书人和被背书人均可操作票据，背书人可撤销背书申请，被背书人可回复（签收或驳回）背书申请。此时，系统按照时间优先的原则进行处理：如背书人先撤销背书申请，则该背书申请已撤销，被背书人不能再进行背书回复操作；
如被背书人先发起背书回复，则该背书申请按照被背书人的意思已签收或驳回，电子银行承兑背书人不能再撤销该背书申请。 电子银行承兑背书应当基于真实、合法的交易关系和债权债务关系，或以税收、继承、捐赠、股利分配等合法行为为基础。
商业承兑汇票和银行承兑汇票的区别在于，承兑人不同，决定了商业承兑汇票是商业信用，银行承兑汇票是银行信用。银行承兑汇票一般由银行签发并承兑，而商业承兑汇票可以不通过银行签发并背书转让，但在信用等级和流通性上低于银行承兑汇票，在银行办理贴现的难度较银行承兑汇票高。