太阳能水泵控制器根据日照强度的变化调节水泵转速，使输出功率接近太阳电池阵列的功率；当日照很充足时，保证水泵的转速不超过额定转速；当日照不足时，根据设定运行频率是否满足，否则自动停止运行。
控制器与电池板、光伏水泵等辅件接线：
1． 光伏水泵U、V、W三相线与控制器上相位对应相接；
2． 电池板串/并连后，正负极对应相接；
3． 本系统可接蓄电池做备用电源，如有需要；
4． 水箱水位传感探测器（可选配件），侦测水箱水位，水满自动停机，反之自动开机。
5． 水井低水位探测器（可选配件），防止因水井水位下降过快，防止水泵过热烧毁。分上中下三位探测。
太阳能是一种环保，绿色、节能的新能源，本身不存在污染。污水处理站作为环保工程，使用太阳能作为能源，进一步体现了工程的环保性。
在不同系统中使用的驱动电机也不同。在小于10阅Np功率等级的光伏水泵系统中,为获得尽可能高的系统效率,多采用直流无刷永磁电机驱动,在大型光伏水泵系统中,仍不乏采用交流异步传动方式者,但是由于近代控制技术的不断发展,为了进一步提高单位峰瓦提供的扬水量,己经开始有被多台水泵实现柔性控制的多机群控技术所替代的趋势。