把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
裁判文书确定
在保函中约定，受益人的索赔请求，必须经过法院或者仲裁机构生效的裁判文书确定，担保银行仅凭仲裁机构的裁决或法院的判决来实施付款或免于付款责任。担保银行于签发保函时往往无法知道申请人在保函所涉及的法律诉讼案件中究竟应承担多大的实际赔偿责任，甚至还不能肯定委托人是否必须作出这样的支付，因此，保函项下是否发生赔付，以及实际上应赔付多大的金额等，都要根据法院的有关判决来确定，而绝不能仅仅依据受益人的单方索赔予以支付。
投标保函：保证人在投标人投标之前，向招标人出具投标保函，保证投标人按照招标文件的规定参加招标活动，并在中标后及时与招标人签订相关工程合同，同时提供招标人所要求的履约、预付款等保函。如果投标人违约，则保证人将在保函金额内赔付招标人的损失。
而保函可以代替保证金，减少企业资金占压，规范建工领域，防止人为粗暴管理钱在甲方那里，退款慢，退款难，看甲方脸色因素，降低企业经营风险 保函分为银行保函，商业保函，保险保证又分为投标保函及非投标保函非投标即。