对于招标审计来说，由于工程施工招投标审计为事后审计， 加上违规手段隐蔽， 往往存在较大审计风险， 在审计过程中应更加注重审计程序到位，掌握招投标审计的重点和方法。 注意审查招标过程中有无人为的压价、哄抬标价或泄露标底的现象，审计人员可以通过查阅比对标底和各家投标单位的投标文件来发现其中的端倪。

招标合法性审计 ，关注建设项目是否符合招标条件，主要审计初步设计及概算、招标范围、招标方式和招标组织形式等是否履行有关审批核准手续；相应资金或资金来源是否得到落实；征地拆迁工作是否已完成；是否具备招标所需的设计图纸及技术资料。另外，关注招标人的招标资格，审计招标人是否具有编制招标文件和组织评标的能力，是否做到谈判、评标、决策分开；如果招标人不具有相关资格，必须委托具备相应资格的招标代理机构组织招标。

招标文件审计，主要审计招标文件中的投标报价要求、评标标准和方法、进度款付款办法、计价取费依据、结算办法、合同主要条款、技术条款、竣工验收后保修工作的措施和承诺以及违约责任等内容。关注是否存在招标人以不合理的标段或工期限制或者排斥潜在投标人或者投标人的现象。

标底文件审计，重点审计报告编制标底依据的招标文件、设计图纸及有关资料是否合法有效；是否由相应执业资质的工程造价专业人员来编制标底；工程量清单的计算、套用定额是否严格按施工图和国家定额的有关规定，编制标底是否合理，是否控制在设计概算以内，有无人为调整标底问题。

建设工程项目招投标专业性强、涵盖面广、体系庞杂，审查工作包括查看招投标文件、现场签到表等相关书面资料，将同一项目不同投标单位的投标文件进行对比，将不同时间段或不同项目的表述进行对比，利用互联网进行各投标单位相关资料查询等：

利用互联网进行各投标单位相关资料查询(例如核实联系电话、公司名称等，可能会发现不同公司联系人号码相同、公司信息有相关性等等问题)、查工商注册资料(例如通过相关机构查询公司股东构成等资料，可能存在不同公司具有相同关联人信息的现象)、查人(例如针对同一个人进行地毯式调查，可能会发现同一人与其他投标单位的内在关系)；对相关工程材料设备等进行询价比对，了解投标单位报价的合理性。