胃肠肿瘤中心一病区是北京肿瘤医院以胃癌、结肠癌和直肠癌诊治为主的外科临床科室。1976年建所初期成立的肿瘤外科腹部外科专业组即为现在胃肠肿瘤中心一病区的前身，是肿瘤研究所成立初期几个主要病种防治研究专业之一。
胃肠肿瘤中心一病区现有病床33张，医护人员37名，其中主任医师4人，副主任医师2人，主治医师5人，住院医师8人，护士18 人。学科带头人季加孚教授，科室副主任李子禹教授，任晖任护士长。
医疗特长及优势：以患者的个体化为宗旨，积极推广胃肠肿瘤的规范化手术，重视综合，提倡人性化服务。胃癌的标准D2根治手术、围手术期综合、胃肠道肿瘤微创手术、胃肠道肿瘤的腹腔镜探查术、胃癌手术中的纳米碳淋巴结示踪技术、早期胃癌的EMR/ESD内镜下、腹腔热灌注化疗及直肠癌的术前放疗等已成为科室特色的常规手段。
现科室年门诊量近13000人，病房年收治患者近1300人，手术量近800台。其中胃癌患者约占2/3，结直肠癌患者约占1/3。规范细致的手术操作、合理的综合、丰富的病例管理经验和人性化的护理是患者疗效为可靠的保障。
北京大学肿瘤医院胸部肿瘤内一科（原胸部肿瘤内科）是以肺癌诊治为主、具有深厚沉淀、传承并不断发展的研究型临床专科，多年来一直致力于中晚期肺癌规范化、个体化内科和多学科综合及相关转化研究。现有病床36张，医护人员30名。10名医生中高级职称医师6名，中级职称医师3名，初级职称医师1名，几乎所有医生均具有硕士或博士研究生学历，3人具有国内外博士后研究经历。护士队伍中，主管护师4名，护师8名，本科及以上学历8名。共同组成一支高素质、高学历、具有丰富临床和研究经验、充满蓬勃朝气和积极进取的医护团队，医教研综合实力达国内水平。
北京大学肿瘤医院淋巴瘤科是我国成立早的淋巴瘤专业科室，经历了36年的发展历程，已经成为我院的特色品牌科室之一，目前拥有普通病床36张，移植舱位4张，专业从事淋巴瘤的临床诊断与、以及自体干细胞移植。收治患者全部为各类型淋巴瘤患者，几乎涵盖世界卫生组织淋巴瘤分类的全部亚型。
我科现有临床医生12人，其中正副主任医师7人、主治医师4人、住院医师1人;护士20人，专业科研人员和技术员各1人，科研护士2人。每年门诊接诊4000人次，新收治住院淋巴瘤患者400例，每月出院患者约200人次。
为了给患者提供更好的个体化综合诊治平台，2005年，以淋巴瘤科为主成立了院内淋巴瘤专业协作组，包括淋巴瘤内科、病理科、外科、放疗科、影像科、核医学科等等，对疑难病例进行全院会诊讨论。
在繁忙的日常工作之外，为了提高淋巴瘤的水平，促进学科发展，也为了给患者提供更多的机会和措施，我科先后承担了30余项国内外新药临床研究。同时作为医院品牌科室和国内少数淋巴瘤专业科室之一，承担了大量北京及外省市疑难病例会诊工作和学术讲座;承担北京大学医学部硕士、博士研究生及住院医师、进修医师、访问学者的部分培训工作;定期为患者及家人举办康复课堂教育活动等等。
感谢患者及家人的支持和理解，也感谢国内外同道的关注和鼓励，淋巴瘤科将继续秉承我院“院有品牌、科有特色、人有专长”的办院宗旨，为来自国内外的淋巴瘤患者提供优质规范的医疗服务和人性化的关怀照顾。
北京大学肿瘤医院放疗科始建于1976年，同年，我国台直线加速器在这里自主研制成功。
放疗科2000年即在国内较早开始开展三维立体定向适形放疗， 2004年在北京市率先开展三维适形动态调强放射，迄今采用调强放疗技术患者超过13000例，并取得良好的疗效。2008年放疗科引进了具有功能的后装机、大孔径CT定位机和20套先进的计划系统， 2009年国内台VMAT在我放疗投入使用;2011年国内台True Beam投入使用;2012年引进国内首套大孔径核磁定位系统放射，在放疗设备的配置方面达到了国际先进水平。