北京空 军总医院学科设置齐全，拥有50多个临床、医技科室，拥有皮肤科、中西医结合正骨科、中医科3个国家中医药管理局重点学科和专科、专病中心，1个全军皮肤病研究所，8个全军医学专科、专病中心，1个国家临床试验机构及全军临床药理基地，设有飞行学员医学选拔中心及一批特色学科。
北京空 军总医院皮肤科组建于1980年，于2013年扩建为皮肤病医院。现为国家中医药管理局中西医结合皮肤病重点学科、全军皮肤病研究所、国家卫生部药品临床研究基地、国家FDA行政许可检验机构、首都皮肤科疑难病诊疗中心、中国医师协会激光美容培训基地、北京市皮肤科医师培训基地、全军皮肤病专业委员会和全军中医药学会皮肤病专业委员会主任委员单位。
北京空 军总医院皮肤科“学科”各类技术人员89人，其中正高级职称9人，副高级职称11人，博士19名，硕士14名。是第四军医大学、第三军医大学、解放军总医院、中国医科大学、安徽医科大学、北京中医药大学等院校的研究生培养点，博士后流动站，现有博士研究生导师4名、硕士研究生导师6名。
北京空 军总医院现有3个国家中医药管理局重点学科（皮肤病重点学科、脊柱软伤专科和代谢病重点专科）、3个军队临床重点专科（口腔、皮肤、航空临床医学）、8个全 军医学专科（专病）中心（临床航空医学、中西医结合正骨、半匹配骨髓移植、肿瘤放疗、小肠疾病内镜诊治、泌尿微创诊疗、优生优育技术指导、心理技术指导中心）、18个专业实验室，主要面向全军承担特殊职业病研究、预防、诊治和应急支援保障任务，承担招收飞行学员体检和飞行人员航空医学鉴定、训练任务及上级赋予的其他任务。