北大医院前身为北京医科专门学校附设诊察所，后陆续更名为北京医科大学校附属医院、北平大学医学院附属医院等。1946年，医院随北平大学医学院并入北京大学，由此得名“北大医院”。1952年，全国高等学校院系调整，北京大学医学院独立建院，设立北京医学院，后又更名为北京医科大学，医院随之先后更名为北京医学院附属医院、北京医学院第 一医院、北京医科大学第 一医院。2000年，北京大学与北京医科大学再次合并，医院随之更名为“北京大学第 一医院”。2008年，医院成为中央保健基地医院。
北大医院学科齐全，综合实力居于国内前列、国际一 流，临床医学一级学科整体进入国家双建设学科范围。现有4个教育部重点学科（牵头），1个国家中医药管理局重点学科（牵头），3个北京市重点学科（牵头），7个教育部重点学科（参与）；获批国家临床重点专科建设项目29次，覆盖25个学科。
北大医院因医学教育而生，始终坚持“立德树人”根本任务。自1977 年至今，医院累计培养本科生 3300 余人，研究生 4000 余人，其中包括硕士 2000余人、博士 2000余人。作为首批国家住院医师规范化培训示范基地，自2005年至今，累计规范化培训住院医师1100余人。现有本科生同期在院440余人，研究生同期在院740余人，毕业后继续教育900余人。
目前，全球约有8.5亿人因各种原因患慢性肾脏病，面对如此庞大的肾脏病患者数量，只有我们人人了解肾病，关注肾病，才能为自己和别人营造更好的生活，才能保障“全民肾脏健康”。