北京儿童医院以病人为中心，全心全意为儿童服务，大力弘扬“公慈勤和”院训精神。医院坚持公益，始终“关注儿童、关注健康”，成立“北京儿童健康基金会”，扶助困难家庭患儿就医;组织医疗骨干参加援疆援藏任务、“人才京郊行”、大型义诊活动，为偏远地区和基层单位的儿童送医、送药、送健康;开展免费救治西藏先心病、唇腭裂患儿活动，举办血友病、糖尿病、白血病儿童夏令营，让患儿感受到社会的温暖。
北京儿童医院先后获得“全国文明单位”“首都文明单位标兵”“首都文明服务示范窗口”“专科医院”“双十佳人民满意医院”“北京三甲医院”荣誉称号及“首都劳动奖状”“全国五一劳动奖状”。
北京儿童医院医院内分泌科矮小专业门诊根据患儿而且具体情况评估可能的诊断，如对于怀疑生长缺乏症的，或者低出生体重、家族性矮小症、特纳综合征等根据情况，选择运动试验，必要时住院进行生长激发实验。同时本亚专业有相应的矮小管理项目，分别进行生活方式干预或者治 疗。本亚专业定期发布的临床试验和医院及的研究试验。
内分泌科是医院中一个专门内分泌科疾病的地方，主要负责糖尿病、肥胖症、骨质疏松、痛风、脂质代谢紊乱以及甲状腺、垂体、肾上腺、性腺、甲状旁腺等疾病的临床诊治。