王永钧长期从事肾脏病临床及研究，对中医经典和历代名家学术思想颇有研究。
王永钧带领肾内科团队，创建了IgA肾病从虚、瘀、风湿辨治体系，提出IgA肾病五型辨证新方案 。王永钧将中西医融会贯通，总结出了慢性肾病临床演变规律，发展了肾脏病中医辩证理论，提出“风湿致肾病”学说和“肾脏微症积”的肾微观辩证法，完善肾脏病中医微观辨证体系，应用源自中华文化的“象思维”，结合“审病—辨证—治病/证”的临床思维方法，拓展了“四诊”视野 ，在此指导下形成了一套分阶段辩证的方案和系列组方，并在临床、科研与实践中得以运用。
人才培养
学科建设
王永钧创建了浙江省个肾脏病内科，该科现已发展为浙江省医学重点学科（肾脏专业）、国家中医药管理局重点专科。
指导学生
截至2022年7月，王永钧已指导培养出数十位肾病学科的领军人物，包括5位肾病专/学科带头人，4位国家名老中医专家学术指导老师，5位浙江省名中医，12位杭州市名中医。王永钧曾任浙江中医药大学硕士和博士生导师，已指导培养博士8名、硕士21名，培养继承人6名，他们中多人分别获得中国中西医结合特殊贡献奖，中国中西医结合青年贡献奖，全国百名杰出中医等。
王永钧年轻时候患过肾病综合征，多位医生都没有没有治好，还是几副草药治好了他的病，从而他对中医产生了兴趣，走上了中医之路。毕业于浙江医科大学医疗系，长期致力于中医药肾病事业的传承、创新和发展。
王永钧知道要成为真正的医生，要学到高超的医术很难很难，但是下定了决心，明确了目标，刻苦努力，就一定能够成功。于是，王永钧开始自学中医著作，开始背诵《汤头歌诀》、《黄帝内经》、《伤寒杂病论》、《药性赋》等各种中医经典著作。