虫草毒性低，小鼠腹腔注射虫草浸提液5g/kg，没有死亡、10-20g/kg则部分死亡。中毒症状是先抑制后兴奋，随即因痉挛和呼吸抑制而死亡。小鼠腹腔注射虫草水提取液LD50为27.8g/kg，皮下注射则为38.0g/kg。小鼠腹腔注射虫草菌水提取液LD50为17.9g/kg，皮下注射则为17.1g/kg。亦有人认为虫草菌水煎剂毒性比虫草为小。虫草菌醇提物给小鼠静注LD50为24.5g/kg，腹腔注射为35.2g/kg。凉山虫草的毒性低于冬虫夏草，小鼠腹腔注射浸剂LD50为24.26g/kg，后者为19.46g/kg。长期毒性试验未见明显异常。小酿灌服虫草或虫草菌耐受量均在45g/kg以上。小鼠皮下注射虫草多糖100mg/kg，连续14d，末见明显毒性。家兔灌服虫草菌水提取液10g/kg，连续3个月，对外周血象，肝、肾功能及各重要脏器均无明显毒性反应，对淋巴细胞微核率、染色体畸变率、姐妹染色单体互换率均无明显影响，提示对机体无明显致突变作用。虫草菌粉1.25-5g/kg给孕大鼠灌服，对其受孕、着床、吸收、活胎数写对照组无差别，胎鼠全部成活，胎鼠体重、体长和尾长与对照组亦无明显差异。
冬虫夏草配枸杞子：冬虫夏草长于温肾补肺；枸杞子善于补益肝肾。两药配伍，可增强温肾补肝的作用。适用于肝肾亏虚之腰痛乏力等。
冬虫夏草配阿胶：冬虫夏草长于温肾补肺；阿胶善于养血止血。两药配伍，可增强温肾助阳，养血止血的作用。适用于气阴不足，劳嗽咳血等。
冬虫夏草配杏仁：冬虫夏草长于温肾补肺；杏仁善于止咳化痰。两药配伍，可增强补益肺肾，止咳化痰的作用。适用于肺痨之阴虚喘嗽，咳血，胸痛等。
黄芪与冬虫夏草：两药均入肺经，均具有补肺气，益卫气，固表而止汗的功效用于表虚自汗之证。然黄芪为补气升阳的要药，又可用治病后体弱，脾气亏虚，气短乏力，食少便溏等，及中气下陷，脾阳不升之久泻脱肛，子宫脱垂者；黄芪又具有生血行滞的功效，用治血虚发热，萎黄心悸，失血崩漏，气虚血滞，风湿痹痛，半身不遂；黄芪又具有补肺气、益卫气，固表而止汗的功效，用治肺气不足，卫阳不固，表虚自汗之证；黄芪又具有温养脾胃而生肌，而托毒，有补气生肌，托毒排脓之效，用治疮疡脓成不溃，久溃不敛等。冬虫夏草性质平和，以益肾为主，兼能止血化痰，善治肾虚阳痿遗精，腰膝酸痛，劳嗽咳血，久咳虚喘等。