先后获国家科技进步二等奖2项、省部级一等奖4项、何梁何利科学技术与进步奖，谈家桢生命科学临床医学奖，转化医学杰出贡献奖，吴阶平医药创新奖，中国工程院光华工程科技奖。北京大学人民医院血液科黄晓军加急住院挂号
造血干细胞移植是白血病的有效方式,供者来源缺乏是一世界性难题，北京大学人民医院黄晓军团队在自创的粒细胞集落刺激因子诱导免疫耐受的基础上，对单倍体移植技术的多个方面进行了创新与改进，形成国际公认的原创非体外去T单倍体造血干细胞移植体系——“北京方案”；“北京方案”白血病取得与同胞全合一致的疗效。２０１６年，该方案被世界骨髓移植协会推荐作为全球缺乏全相合供体的移植可靠方案；该方案还被写入国际骨髓移植教材，并被美国、英国等国骨髓移植相关指南引用。
黄晓军医生擅长
血液系统疾病，造血干细胞移植（HSCT）后的移植物抗宿主病（GVHD）、感染和复发等各种移植合并症的诊断和处理
黄晓军，男，1964年生，汉族，江西省南丰县人，北京大学人民医院血液病研究所所长，主任医师、教授。
1987年毕业于中山医科大学医疗系。
1992年于北京医科大学获医学博士学位。
1997年-1998年在美国Einstein医学院肿瘤研究中心从事血液恶性肿瘤新的研究。
1989年开始从事血液病临床及实验研究，对造血干细胞移植技术及其各种合并症、各种急慢性白血病的诊断有丰富的临床经验。率先探索并完成了人类白细胞抗原(HLA)不合/单倍体HSCT(hematopoieticstem cell transplantation)的临床和实验研究;在国内早成功开展了非血缘HSCT，创立并完善了非血缘HSCT的技术体系;领导了非清髓HSCT的临床工作;对HSCT后复发白血病的传统技术进行了改造。
是个感染指南的执笔者及制定者之一。