医疗体检健康体检与医疗体检在体检方法有很多共同之处，而在项目组合、科室构架、制度管理、体检结果处理和交流又与医院体检有很多不同。
1.
服务对象不同：健康体检服务对象是主动防病查体的“客人”；医疗体检服务对象是因疾病或伤痛而就医的“患者”。
2.
指导思想不同：健康体检指导思想是“预防为主”、“治未病”；医疗体检指导思想是“救死扶伤”、“治病救人”。
3.
目的不同：健康体检的目的是在健康人群中，通过查体发现异常体征，提示可能威胁健康的因素；医疗体检的目的是根据病痛症状，通过查体发现其原因和部位，明确诊断，为提供依据。
4.
中心不同：健康体检是以“健康”为中心的体检过程和结论；医疗体检是以“病痛”为中心的体检过程和结论的目的是根据患者或家属对病痛症状的主诉，通过查体发现其原因和部位，以明确诊断，为提供基础。
5.
项目不同：健康体检的项目与医疗体检项目有所区别。国家有关部位颁布的《学生健康标准》《中国成年人体质测定标准》是我们评定体质的标准，并根据其要求设定了体能测试、心理测查；以及如微量元素、肿瘤标志物甚至基因性质的检测项目，在一般医疗体检中是没有的。
6.
“产品”不同：健康体检的结果是终做出健康体检的汇总报告，即在本次体检中发现的异常体征的解释、分析和处理建议。而医疗体检的结果是书写病历和病程记录，通过有效的，消除病痛和症状。
7.
场地不同:健康体检机构大多平面设计，分男女不同性别的体检线；而医疗体检是以科室设置，完成全项检查多需楼上楼下反复多次，可能与病人交叉，增加感染机会。
8.
方法相同:西医有视诊、触诊、叩诊和听诊，中医有望诊、闻诊、问诊和切脉。心电图机、B超机、X光机、血生化分析仪等设备与医院是相同的。主要由医务人员组成是相同的。